实践中会出现原合同已经不够约定双方的事项，需要补充一个合同，充实原合同的内容，那么补充的合同有效吗？原合同我们称为主合同，而补充合同是主合同的从属合同。
补充合同依附于主合同而成立，没有主合同，就不会产生补充合同，这是主合同与补充合同的基本关系。主合同因为有了补充合同，所以使得主合同原意更准确、更完善、更具有可操作性。
补充合同的编号往往是以主合同为依托而表达的，如__号合同补1、补2，这是强调二者主从关系的实质体现。
因为有了补充合同这种特殊形式，能够保证双方履约顺利，合同纠纷减少。所以，实践中还是不能忽略补充合同的效力，在出现主合同效力和补充合同效力矛盾的时候，需要以补充合同的效力为准。
当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。所以，补充合同的效力优于主合同的效力。
时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质。如果仍以主合同的原条款为准执行，那就失去了补充合同存在的意义。
严格而言，合同补充协议是对原合同未尽事宜，或者合同履行过程新发生的情况而另外进行的约定。与合同的变更协议不同，但实务中订立的以“补充协议”为名的协议，其实质内容却常是合同的补充并有变更。
因此，在签订时要特别注意以下三个问题：
1、补充协议的当事人应当与原合同当事人严格一致；
2、补充协议的形式应当与原合同一样完备；
3、严格防止与原合同发生内容矛盾。